Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms