Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms