Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf4Q06507 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms