Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms