Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fmn1Q05860 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fmn1Q05860 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fmn1Q05860 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Fmn1Q05860 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms