Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms