Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms