Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox8Q04886 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms