Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfiaQ02780 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms