Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GscQ02591 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GscQ02591 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GscQ02591 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GscQ02591 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GscQ02591 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GscQ02591 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GscQ02591 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GscQ02591 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms