Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd1Q02242 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms