Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcqQ02111 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms