Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb2Q00977 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms