Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Serpina1cQ00896 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms