Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nbr1P97432 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms