Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx2-3P97334 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-3P97334 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms