Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3f3aP84244 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3f3aP84244 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms