Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms