Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx1P80205 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms