Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms