Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra8P70278 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra8P70278 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms