Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NficP70255 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NficP70255 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NficP70255 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NficP70255 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NficP70255 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NficP70255 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NficP70255 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NficP70255 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NficP70255 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NficP70255 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NficP70255 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms