Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd13P70217 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms