Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SbdsP70122 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms