Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl18aP62717 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms