Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpfP62307 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms