Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vbp1P61759 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms