Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2nP61089 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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