Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chp1P61022 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chp1P61022 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chp1P61022 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms