Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp1P60335 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms