Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf2P59222 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms