Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl4P58321 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl4P58321 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms