Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CdaP56389 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CdaP56389 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CdaP56389 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CdaP56389 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms