Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CartptP56388 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CartptP56388 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CartptP56388 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CartptP56388 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CartptP56388 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CartptP56388 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CartptP56388 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CartptP56388 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CartptP56388 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CartptP56388 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CartptP56388 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CartptP56388 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CartptP56388 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CartptP56388 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CartptP56388 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CartptP56388 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CartptP56388 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CartptP56388 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CartptP56388 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CartptP56388 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CartptP56388 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CartptP56388 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CartptP56388 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CartptP56388 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CartptP56388 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms