Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh11P55288 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh11P55288 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms