Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms