Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccr4P51680 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms