Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms