Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx3P50481 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms