Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Abcd1P48410 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcd1P48410 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms