Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VdrP48281 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VdrP48281 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VdrP48281 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VdrP48281 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VdrP48281 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VdrP48281 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VdrP48281 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VdrP48281 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VdrP48281 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms