Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgavP43406 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgavP43406 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ItgavP43406 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.5 ms