Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms