Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox6P40645 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox6P40645 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox6P40645 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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