Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab20P35295 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab20P35295 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms