Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sftpa1P35242 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms