Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms