Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RxraP28700 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RxraP28700 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RxraP28700 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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