Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DcnP28654 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcnP28654 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DcnP28654 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DcnP28654 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DcnP28654 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcnP28654 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms