Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms